1、二者含义不同

　　在职博士：在职博士也成为非全日制博士，是指学习方式相对脱产形式而言，通过正常入学考试(统考或单考)取得入学资格，在培养单位教学或培养方案许可的情况下，一边工作一边学习的博士生。

　　全日制博士：全日制博士，是指符合国家博士研究生招生规定，通过研究生入学考试或国家承认的其他入学方式，被高校录取并全脱产在校学习的博士。简单来说就是按照国家法定工作、学习时间进行全天候学习的一种方式。

2、招生对象不同

　　在职博士：报考在职博士的学员都是社会在职人员，而且想要报考必须要获得硕士学位满5年，这也是报考的硬性要求，同时年龄不能过大，而且考生需要边学习边工作。

　　全日制博士：全日制博士基本都是应届硕士毕业生，他们是不需要边学习边工作的。

3、上课方式不同

　　在职博士：在职博士完全是借助业余时间进行授课，主要授课方式为周末班和集中班。周末班一般为周六、日或其余的时间进行课程学习。集中班为集中一段时间进行集中面授的串讲和答疑。

　　全日制博士：全日制博士要求学员必须全天在校上课，上课时间为周一到周五的正常工作日。

4、获得证书不同

　　在职博士：在职博士分为同等学力博士和双证博士，单证在职博士可以在毕业时获得博士学位证书，双证在职博士可以在毕业时获得博士学位证书和博士学历证书。

　　全日制博士：全日制博士参加统一入学考试被学校录取之后，通过脱产学习毕业时会获得毕业证和学位证。